根據前師大教授章熙林博士的研究，台灣北部壺穴的起源有多重原因，最主要有以下幾點：

1. 降雨(Rainfall)：台灣北部處於東北信風帶，冬季受猛烈東北季風的加強作用，夏季則因山丘起伏使溼氣凝結而降雨，雨水充分供應使河流侵蝕力旺盛。
2. 河流坡度(Stream Gradient)：基隆河自源流到七堵的上游河道坡度達1/108，且遍布大、小瀑布、急流，導致水流通過時易生急浪而產生壺穴。
3. 塊體崩壞(Mass Wasting)：即山崩使得土石掉入河中，河流挾帶粗糙的沙石，可加速壺穴的形成。
4. 節理(Joints)：壺穴產地往往有許多節理（岩石脆弱地帶），河水挾帶砂石便極易在節理面產生磨蝕而形成壺穴。
5. 回春(Rejuvenation)：當河谷回春時，河流的侵蝕基準面降低，垂直方向的磨蝕作用增強，壺穴自然較易產生。據地質學家估計，台北盆地附近的大屯火山群曾於二百多萬年前爆發，岩漿噴出後，岩層內部清空，失去支撐力量，造成台北盆地陷落，使得河流侵蝕基準面下降，造成回春現象，河流又再繼續往下切蝕。